XcodeのOrganizerのArchives（アーカイブ）は何故か全選択できないので一括削除が出来ません。
よって、Xcode上では一個ずつ削除するしかありません。
これでは非常に非効率で途中で嫌になりますよね。しかし、一括で削除する方法が存在しました！
XcodeのOrganizerのArchives（アーカイブ）を一括で削除する手順。
注意: アプリ別で一括削除は出来ません。一度に全アーカイブを全削除することになるのでご注意ください。
Xcodeを起動して、XcodeのメニューバーからWindow内にあるOrganizerをクリックします。↓↓
適当にアーカイブを右クリックして、「Show in Finder」をクリックします。↓↓
Archivesをクリックします。パスバーのArchivesをクリックします。（パスバーが表示されていない場合は、Finderのメニューバーの表示からパスバーを表示をクリックします。）↓↓
すると、Archives内のフォルダをcommand + Aで全選択し、command + delでゴミ箱に入れましょう。↓↓
再びOrganizerのArchivesに戻ると全て削除されています。↓↓
この方法は、@_moto_yさんに教えていただきました。ありがとうございます！
@isloop @RucKyGAMES Xcodeのメニューの Window/Organizer/Archives のファイルを消すと身軽になれますよ。フォルダだと (home)/Library/Developer/Xcode/DervedData/ です (^^)
— もと (@_moto_y) 2016年6月24日